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Apr 26, 2024

無症候性の地域社会の上気道における呼吸器系ウイルスの検出

BMC 感染症第 22 巻、記事番号: 411 (2022) この記事を引用 1572 アクセス数 3 引用数 46 Altmetric Metrics の詳細 上気道におけるウイルス陽性の蔓延

BMC 感染症第 22 巻、記事番号: 411 (2022) この記事を引用

1572 アクセス

3 引用

46 オルトメトリック

メトリクスの詳細

無症状の地域在住高齢者の上気道におけるウイルス陽性の蔓延は依然としてとらえどころのないままである。 私たちの目的は、唾液サンプルと鼻咽頭および中咽頭ぬぐい液を使用して、無症状の地域在住の高齢者における呼吸器ウイルス PCR 陽性率を調査することでした。

私たちは、2018年2月から12月まで日本の長崎市で実施された横断研究に登録された、歩行可能な地域在住の65歳以上の成人504人を分析しました。 マルチプレックス PCR アッセイを使用して、唾液、鼻咽頭および中咽頭のサンプルから 14 種類の呼吸器ウイルスが同定されました。

ライノウイルス、インフルエンザ A 型、エンテロウイルス、およびその他の呼吸器ウイルスの PCR 陽性率は、12.9% (95% CI: 10.1 ～ 16.1%)、7.1% (95% CI: 5.1 ～ 9.8%)、6.9% (95% CI:それぞれ4.9～9.5％）と25.2％（95％CI：21.5～29.2％）でした。 唾液採取のみを使用した場合、被験者の21.5%でライノウイルス、被験者の38.9%でインフルエンザA、被験者の51.4%でエンテロウイルス、被験者の32.3%で任意のウイルスが検出されました。

いくつかの呼吸器ウイルスの有病率は、若年成人の咽頭サンプルで以前に報告されたパーセンテージよりも高かった。 唾液サンプリングは、無症候性集団における呼吸器ウイルス検出に潜在的に有用な方法です。

査読レポート

より広範な臨床現場でのポリメラーゼ連鎖反応 (PCR) の導入により、呼吸器ウイルスの迅速かつ正確な検出が容易になり、呼吸器ウイルスが市中肺炎の一般的な病原体であることが明らかになりました [1、2、3]。 いくつかの研究では、無症候性被験者の上気道におけるウイルス陽性の蔓延が報告されている[4、5、6]。 しかし、感染すると重症化しやすい地域在住の高齢者の有病率はまだ調査されていない。

分子生物学的手法を使用した鼻咽頭における呼吸器ウイルス検出は、ウイルス呼吸器感染症を検出する標準的な方法です [7]。 ただし、唾液検体は代替サンプルとなる可能性があります。 唾液サンプリングは侵襲性が低く、鼻咽頭 (NP) 綿棒サンプリングよりも感染のリスクが低くなります。 PCR ベースのウイルス検出のための唾液サンプリングの利点は、一般的な呼吸器ウイルスおよび重症急性呼吸器症候群コロナウイルス 2 (SARS-CoV-2) に感染した患者において報告されています [8、9、10、11、12]。

この研究の主な目的は、日本の無症状の地域在住高齢者における呼吸器ウイルスの PCR 検出率を調査することでした。 第 2 の目的は、無症候性集団における有病率監視のために、咽頭サンプリングに加えて唾液の使用の可能性を探ることでした。

この分析は、以下の既存の研究「地域在住の高齢者における肺炎球菌の低い保菌率：日本における横断研究」に基づいて実施された[13]。 すべての方法はヘルシンキ宣言に従って実施され、この研究は長崎大学熱帯医学研究所の倫理審査委員会および各研究施設の治験審査委員会によって承認されました。 すべての参加者またはその家族から書面によるインフォームドコンセントを得た。 この研究は2018年2月から2018年12月まで日本の長崎市で実施されました。 調査対象には、長崎市の 4 つの病院で外来通院またはリハビリテーションの外来通院を行っている、地域在住の 65 歳以上の高齢者が含まれていました。 発熱や上気道感染症の症状がある人、過去30日間に抗生物質による治療を受けた人、過去30日間に7日以上病院や長期介護施設に入院した人は除外された。 504 人の参加者の詳細な人口統計および臨床情報は以前に記載されています [13]。 NP および中咽頭 (OP) サンプルは、2 つのスワブを使用して取得しました。1 つのサンプルは、アルミニウム シャフト (TE2201) (栄研化学株式会社、東京、日本) 付きの滅菌スワブを使用して鼻咽頭から採取し、もう 1 つのサンプルは、アルミニウム シャフト (TE2201) 付きの滅菌スワブを使用して中咽頭から採取しました。木製シャフト (TE8201) (栄研化学株式会社、東京、日本)。 これらの綿棒を直ちに個別に 1 ml のスキムミルク - トリプトン - グルコース - グリセロール (STGG) 培地に入れました [14]。 参加者は、滅菌した喀痰容器（DE2000）（栄研化学株式会社、東京、日本）の内側に唾を吐き、喀痰のない純粋な唾液を採取するように依頼されました。 これらの滅菌綿棒と喀痰容器の使用方法の詳細は、製造元からオンラインで入手できます [15]。 サンプルは研究者または訓練を受けた研究看護師によって収集されました。 QIAamp ウイルス RNA Mini Kit (QIAGEN Inc.、Valencia、CA、USA) および QIAamp DNA Mini Kit (QIAGEN Inc.、Valencia、CA、USA) を使用してウイルス核酸を抽出し、以下の 14 種類の呼吸器ウイルスをマルチプレックスでスクリーニングしました。 RNA ウイルス用のワン ステップ RT-PCR キット (QIAGEN Inc.、カリフォルニア州バレンシア、米国) および GoTaq Flexi DNA ポリメラーゼ (米国カリフォルニア州サン ルイス オビスポの Promega) および PCR ヌクレオチド ミックス (米国カリフォルニア州サン ルイス オビスポの Promega) を使用した PCR アッセイ、カリフォルニア州、米国）DNA ウイルスについては前述のとおり [16]: インフルエンザ A、インフルエンザ B、呼吸器合胞体ウイルス (RSV)、ヒトメタニューモウイルス (hMPV)、パラインフルエンザ ウイルス 1 ～ 4 型 (PIV-1、PIV-2、 PIV-3 および PIV-4）、ライノウイルス、コロナウイルス 229E、OC43（一般的なヒトコロナウイルス [HCoV]）、アデノウイルス、ボカウイルス、およびエンテロウイルス。 追加ファイル 1 は、マルチプレックス PCR の感度 (検出限界) を示します [追加ファイル 1 を参照]。 呼吸器ウイルスの PCR 陽性の有病率は、少なくとも 1 つの NP、OP、および/または唾液サンプルで検出された全有病率として定義されました。 PCR 陽性率の計算は追加ファイル 2: 図 S1 に示されています。 コーエンのカッパ係数 (κ) を計算して、サンプリング サイトの各ペア間の一致を測定しました。